En 1965, deux garçons, Téo et Luis, s'amusent dans la ville déserte de Marienbad. La construction d'un barrage va submerger la ville dont tous les habitants ont été évacués. Tous sauf les membres d'une secte, cachés dans l'église dont le chef Mordecai Salas va être libéré par Téo....
Le professeur Bacterio s'est fait dérober sa plus redoutable invention. Elle est à présent aux mains d'un dictateur certes petit, mais complètement dingue et décidé à s'en servir. Super sait parfaitement qu'il ne peut pas compter sur ses agents Mortadel et Filémon pour sauver le...