Rei est une agent de la Section Zéro du département de police de Tokyo. Sans identité et sans passé, elle est chargée de résoudre les cas insolvables par ses collègues, incluant l’exécution pure et simple de criminels qui ne peuvent être changés. Sa docilité envers ses supérieurs...
La légende veut que Tokyo fût construite dans la région de Kanto, à l'endroit même où, plusieurs siècles plus tôt, le guerrier Masakado tenta de créer une cité vaste et prospère. Bien qu'assassiné avant d'avoir pu réaliser son rêve, l'homme continue aujourd'hui encore de veiller...
Fasciné par sa mère disparue, Akira essaie de retrouver les paroles d'une comptine qui évoque pour lui le bonheur, la période heureuse et insouciante de l'enfance.