Yuzuru Kurojima est le directeur d'un centre d'excuses basé à Tokyo. Son travail consiste à enseigner aux autres comment s'excuser. Yuzuru Kurojima résout les problèmes en utilisant des techniques d'excuses très spéciales et s'affaire à tout type de cas passant ainsi d'un simple arbitrage...
Au lendemain de la venue du premier Godzilla en 1954, le gouvernement japonais met en place une force spécialisée dans la destruction des monstres. Très efficace, celle-ci résiste à bien des envahisseurs, mais pas à la venue de Godzilla en 1999. Le gouvernement japonais ne s'avoue pas vaincu...